Un grupo de científicos investigan en Turquía algo relacionado con antiguas civilizaciones, dicho grupo es llamado "Spriggan". Pero pronto se pierden contacto con ellos y otro Spriggan de Japón, Yu Onimae, contraviniendo las órdenes va en su ayuda. Nada más llegar es atacado y alguien de la antigua base científica le ayuda... acaba de empezar una lucha que podría destruir a la humanidad.
