Durante la ceremonia de apertura de la Cumbre de Tokio ocurre una explosión a gran escala. Conan sospecha de un caso similar anterior que culpabiliza a Kogoro Mouri, que perteneció a la policía. Junto a Tooru Amuro de la Policía Nacional de Seguridad Pública, Conan empieza una investigación sobre esta conspiración donde la Cumbre coincide con la vuelta a la Tierra de la nave espacial no tripulada Hakucho desde Marte.
