Después de recibir una invitación a retar al mejor entrenador a una batalla, se encamina con sus amigos Misty, Brock y Pikachu a través de la tormenta hacia la isla donde en lugar de un entrenador lo espera Mewtwo, un pokémon creado genéticamente por el Rocket Team como arma y que ahora intenta vengarse de los humanos que intentaron usarlo.
 | Veronica Taylor | Voz de Ash Ketchum / Voces adicionales |
| Philip Bartlett | Voz de Mewtwo |
| Rachael Lillis | Voz de Misty / Jessie / Wigglytuff / Voces adicion |
| Madeleine Blaustein | Voz de Meowth / Científico / Entrenador de piratas |
