En Cyborg 009, también llamada Agente Espacial 009, prototipos de cyborgs han sido desarrollados por el Fantasma Negro, una diabólica organización de mercaderes de la muerte, que organizan guerras y hacen armas por motivos monetarios. Sin embargo, junto al Dr. Gilmore, los nueve cyborgs escapan y empezarán a luchar contra el Fantasma Negro, en especial 009, el de más reciente creación.
